瑜珈行者有一項很重要的發現，就是身體錯綜複雜的功能， 是由許多不同的腺體系統來指揮；這些分泌的化學物質，現代科學家稱為荷爾蒙。荷爾蒙對身體產生很大的影響，例如生長、消化、精力、情緒…等；譬如甲狀腺分泌過多的甲狀腺素，會使很正常的人緊張與暴躁。瑜珈體位法可刺激腺體調整荷爾蒙的分泌，進而對人體的身體層面以及心理層面有好的影響。

在瑜珈生理學中，認為人類的五十種心理傾向，如害怕、害羞、生氣…等，都是由沿著脊椎到頭頂的七個脈輪所控制(而脈輪又控制腺體)。由於心靈的渙散、不集中，這些傾向急欲藉由不同的狀態發洩，結果造成心理的不平衡，也使得心靈動盪不安，無法歇息。這些習性、傾向均由腺體所影響，只要我們鍛鍊、調整腺體的分泌，就能控制習性及心理的平衡。

1. 脈輪的作用：
   • 海底輪：位於肛門附近的腺體中心，是各種身體、心智、和靈性渴望的貯藏所，控制著人體中固體的成分，和身體健康、排泄功能有關。
   • 生殖輪：它位於生殖器官部位附近的腺體中心，它控制了性線及身體中的液體成分，主宰人的性功能。
   • 臍輪：位於肚臍附近的腺體中心，控制了身體中火的成分及胰臟和腎上腺的分泌，主導我們的活力和世俗的活動，支配人的精力和消化功能。
   • 心輪：它位於靠近心臟附近的腺體中心，控制著氣體的成分，也控制了胸部的胸線和淋巴腺，和人體的呼吸、循環功能有關。
   • 喉輪：位於喉頭附近的腺體中心，控制著以太成分及甲狀腺及副甲狀腺，與說話功能有關。同時它也調整了人體的精力，並控制著人體的活動。
   • 眉心輪：位於腦的正中，它控制著腦下垂體並使用松果體和下視丘的荷爾蒙，主宰世俗和靈性的知識，支配著心神方面的功能。
   • 頂輪：它位於腦頂，超越了生物學及心理學的範疇，它的功能只能用哲學和靈性的語言來描述。

根據瑜珈的學理，人體是由五大元素所組合成的，即以太、氣、火、水和土，並由身體中不同的脈輪所支配。人體身體內的七個脈輪，分別控制著身體的某個特殊部位和某些內分泌腺體。

以上這七個脈輪和內分泌腺的平衡與否，並直接影響人的身心健康。內分泌亦由這七個脈輪所支配，人的疾病也是由於這些脈輪其中之一的衰退，或是一個以上的脈輪的功能失去平衡所致。瑜珈體位法的目的和概念，就是透過伸縮及伸展，強化各個脈輪，使各種不同的內分泌腺的分泌功能處於均衡狀態，以維持身體的健康。

在人體最上方的二個脈輪主導純靈性的功能；較低的三個脈輪則幾乎完全是屬於身體上的功能；中間的二個脈輪則是執行心智和心智趨向靈性的活動。較高的脈輪也控制了在它下方的脈輪的運作，因為靜坐能強化較高的脈輪，使人的心靈更精細、更擴展、更善於運用身體做精細而神聖的活動。

所以一個完整的瑜珈課程，不只瑜珈體位法鍛鍊身體而已，同時也包括其他的層面，如靜坐以擴展心靈的鍛鍊。接下來談到的是瑜珈的體位對身體的影響。

2. 瑜珈姿式對腺體的影響：
   • 身體內的內分泌腺支配著身體的活動，內分泌腺分泌荷爾蒙到血液裏，這些荷爾蒙藉著血液的運送，分布到不同的器官，以控制身體的消化作用、身體的活力、體溫和、身上的水分、身體的成長、細胞的補充、性功能等。這些內分泌腺體和七個脈輪都均有密切的關係。
     脈輪控制了內分泌腺的分泌，產生許多不同的荷爾蒙，而這些荷爾蒙流入血液，影響身體所有的器官。因此脈輪以內分泌腺來控制身、心的活動，當腺體的分泌作用正常時，人的身體健康，心智安定。而當任一腺體功能失常時，也就是分泌作用不平衡時(無論分泌太多或太少)，便會導致身、心的疾病。因此練習瑜珈體位法時，要知道哪些瑜珈體位法對哪些脈輪有作用，以增強其效果。
3. 各腺體的功能：
   • 松果體：
     松果體一般認為它是我們的生物時鐘，它能分泌出許多微妙的荷爾蒙，且足以影響身體所有器官。目前已能分離的荷爾蒙是美拉扥寧(Melatonin)它可以延緩老化，增進免疫的反應，使人具有宇宙感，增加對痛苦的忍受力，減低性衝動，減少睡眠等。而且它能從環境中諸如光線、溫度、溼度、磁場等條件，轉化為神經內分泌的反應。當我們睡得愈深沉的時候，松果體的分泌愈多，睡德愈熟，美拉扥寧分泌愈多。美拉扥寧由色拉扥寧(Seratonin)合成而來，白天時人類有意識的活動極為活躍，心靈動盪散亂，此時需要更多的色拉扥寧來供應神經細胞。而到了晚上或靜坐時，情形就恰恰相反，有意識的活動變少了，因此有更多的色拉扥寧(Seratonin)合成為美拉扥寧。
   • 腦下垂腺：
     與眉心輪有關聯，腦下垂體是一個非常重要的腺體，腦部直接刺激這個腺體，重生各種不同的荷爾蒙，如傳達荷爾蒙的「消息」到所有身體下方的其他腺體，刺激它們執行各種不同的任務。以這種方法，腦下垂腺控制身體許多活動，例如腺體分泌、血液循環、生長和體溫等。當腦下垂腺功能失常時，會產生許多疾病。而且身體會不正常的發展，或者變得很胖，或者過高，或者過於矮小。巨人症及侏儒症，就是因為腦下垂腺功能失常。
   • 甲狀腺和副甲狀腺：
     與喉輪有關聯，頸部的甲狀腺和副甲狀腺，控制了身體新陳代謝的作用，此外也能調整身體所產生的熱量和能量，促進消化及成長。 若是甲狀腺分泌不正常，身心的健康都會受到嚴重的影響。如果甲狀腺分泌稍微多點，就會感到緊張、易怒等。如果分泌再多些，則會非常的神經質、出汗、顫抖、消化不良、失眠，而迅速地消瘦。反之，如果甲狀腺分泌稍少些時，就會疲倦，昏昏欲睡。如果分泌過少時，則行動緩慢，脈博和心跳遲緩，體溫下降，說話口齒不清，感覺遲鈍，身體發胖。
     副甲狀腺控制血液中的鈣含量，負責骨骼成長的正常化。因為骨骼需要鈣，此外，神經作用受血液中的鈣含量影響很大。如果鈣含量太少，我們會變得緊張、衝動、易怒；但如果鈣含量太多，我們便會昏昏欲睡，無精打采。因此，副甲狀腺對骨骼的發展和對神經系統的正常功能，都有很重要的影響。
   • 胸腺：
     胸腺位於心臟附近的胸骨後面，於胎兒時期最為活躍，以建立起身體的免疫系統，出生後分泌胸線生成素來增強免疫系統。其基本功能為每一個細胞打上能夠辨識的記號，防止免疫細胞反抗並摧毀我們身體自己的細胞。使身體能夠抵抗疾病的傳染。
   • 腎上腺：
     與臍輪有關聯。腎上腺正位於腎臟的上方，它能使身體突然產生熱和能。腎上腺在緊急事情發生時，尤為重要。當一個人面臨危險或急迫的事件時，如和敵人作戰，解救即將溺死的小孩，逃避火災、地震等，腦裏便會送一個信號給腎上腺，而腎上腺立即運送它的分泌物(即腎上腺素)至血液中。腎上腺素能使心跳加速，血管擴張，且隨著血液流入肌肉，因此肌肉能從陡增的血液中，獲得更多的活能，而充分發揮工作效率。腎上腺素還會刺激汗腺，因此雖是突然的用力使身體變熱，也能藉著出汗來排熱。此外，腎上腺素也在同時送信號到肝，使肝送出它儲藏的糖到血液中，以供身體所需的額外熱能。如果腎上腺素分泌過少，那麼在危險、急迫時的適應能力就大大地降低了。反之，若分泌過多，則身心將一直處於緊張的狀態中。
   • 胰腺：
     也與臍輪有關聯，胰腺散佈於胰臟消化腺泡之間，它分泌一種消化的荷爾蒙叫做胰島素。胰島素可減低血液中糖的成分。如果胰島素缺乏，血糖增高，部份則隨尿排出，成糖尿，即所謂的糖尿病。反之，如果胰島素分泌過多，則會重生血糖過低的病症，人體會有虛弱、頭痛、發抖、昏眩、神經緊張，和心緒不寧的症候出現。
   • 性腺：
     與生殖輪有關聯，性腺(卵巢或睪丸)不僅能產生卵子和精子，而互相結合繁衍後代，同時它還能分泌性荷爾蒙(性腺素)，即男性激素和女性激素。性荷爾蒙能增加男(女)性的性特徵以及調整性行為的發展。男性激素能增加肌肉的能量，且使人富創造力、及積極性。而女性激素能增加身體脂肪的成份，使人富於情感，思緒細密。不論男女，在他們的體內均會產生男性激素和女性激素，不過是男性產生的男性激素多些，而女性產生的女性激素多些。當然性荷爾蒙的比例，直接關係著男子與女子的體態、思想、情緒及心理方面。如果這些性荷爾蒙的比例失常，則女性會變得男性化，而男性也會變得女性化。
   • 瑜珈動作對腺體的影響：
     人的身體可說完全受各種腺體荷爾蒙分泌所控制，每一個器官、細胞都直接受這些荷爾蒙的影響。所以，荷爾蒙分泌正常時，人體才能正常地成長，若有任何一種腺體分泌不平衡，就會引起身心兩方面不同程度的疾病。瑜珈動作能使各個腺體的分泌作用趨於平衡。瑜珈動作的扭轉或彎曲姿勢，通常需停頓相當一段時間，在這段時間中，所給腺體的壓力，正是要強化這些腺體，使其分泌正常。